Biotop zahrnuje oligotrofní až mezotrofní, zásadité až vápenaté, sladké až mírně slané stojaté vody v různých nadmořských výškách. Jde zejména o jezera, štěrkovny, nivní a rašelinná jezírka apod.. V těchto trvalých, zřídka i dočasných stanovištích, se zpravidla rozvíjí druhově chudý, často monodruhový porost parožnatek, který je vždy v úzké vazbě na chemické složení vody a obsahu v ní rozpuštěných živin. Ve velmi čistých vodách parožnatky mohou pronikat i do větších hloubek, a to i více než 20 metrů. Parožnatky jsou však velmi citlivé na znečištění vody. Často nesmí být překročen ani limit 0,02 mg/l fosfátů ve vodě. Samozřejmě některé druhy jsou i mnohem odolnější, jako třeba Chara fragilis a Chara vulgaris, které mohou růst i ve vodách eutrofních.